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發表於 2023-7-17 14:35:11 | 顯示全部樓層 |閱讀模式


调用了 67 个 CNV(图 3 )B)。在下采样的 70×Twist 外显子组中,6 个重复和 1 个缺失未超过 对于全基因组测序,通常只能获得 30-40 倍的平均覆盖度,但外显子组测序则不同,因为单个探针的捕获效率差异导致覆盖度更加不均匀。各种研究试图通过使用覆盖度和变异识别统计数据比较不同WES试剂盒之间的性能以及与WGS


选择哪种测序平台做出明智的决定[ 26 , 36 , 37 ]]。在这里,我们表国家电子邮件列表明 Twist 外显子组覆盖比其他外显子组试剂盒的覆盖更均匀和一致,并且未充分覆盖的编码碱基的比例要小得多。虽然不如 WGS,但结果非常相似。这些改进可能是外显子组试剂盒中更多或更好平衡的寡核苷酸库(即诱饵)的结果;然而,供应商通常不会共享各个序列的详

细信息和摩尔浓度。 我们的结果表明, Twist 外显子组的平均覆盖度低于常用的 100–120× [ 38 ],但在更高的覆盖度下,Twist 外显子组将实现与其他外显子组试剂盒相似的性能。我们发现,平均覆盖度为 70 倍时,SNV 检测的灵敏度几乎不受影响,并且对 CNV 检测的灵敏度影响很小。根据我们的经验,CNV 检测的敏感性可能更多地取决于用于 CNV 检测的

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